智睿医药虚拟筛选出抗2019-nCoV药物40个,其中包括达芦那韦等!

2020年2月6日

届时新型冠状病毒肺炎疫情防控形势依然相当严峻。各大医药企业、医院以及研究人员纷纷拿出自己的“法宝”加入此次疫战。

广州智睿医药科技有限公司依托广州呼吸健康研究院(钟南山团队)、中山大学生命科学学院等开展新药发现工作,研究团队拟通过人工智能筛选、活性验证和成药性评价的“三步走”方式进行抗2019-nCoV新药研发,利用人工智能辅助的虚拟药物筛选系统,以2019-nCoV冠状病毒主蛋白酶(3CLpro)的高分辨率晶体结构对收录已上市药物进行计算筛选,筛选获得打分较优的潜在有效化合物40个!

根据新型冠状病毒的结构,我们推断:主蛋白酶(3C样蛋白酶3CLpro)是可靠的靶点。原因有两个:

其一,冠状病毒生命周期各环节中,病毒侵入宿主细胞后复制过程是其生命周期的重要一步。当病毒附着并侵入宿主细胞后,病毒劫持宿主的核糖体并用于翻译其自身的复制酶多蛋白(ppla和pplab)。只有主蛋白酶(3C样蛋白酶3CLpro)将复制酶多蛋白水解成独立的蛋白单元后,病毒才能进行正常的复制和转录。主蛋白酶是冠状病毒所特有,在人体内并没有与其相似或相同的蛋白,有效地抑制该酶的水解作用,可阻断冠状病毒的复制过程。

其二,将冠状病毒属的三个基因型用于同源建模,并与冠状病毒主蛋白酶的四个晶体结构对比发现,主蛋白酶有一个高度保守的底物识别口袋,特异性好。

值得注意的是,该靶点也得到其他专家认可,如中国科学院上海药物研究所和上海科技大学免疫化学研究所抗2019-nCoV病毒感染联合应急攻关团队及中国药科大学陆涛/陈亚东课题组。

以2019-nCoV水解酶(Mpro)为靶点发现了40种可能对2019-nCoV有治疗作用的药物。智睿医药科研团队分别调动平台中上市化合物库、临床化合物及活性化合物库,借助人工智能辅助建模筛选包括达芦那韦、阿巴卡韦抗HIV药物,抗肝炎病毒药物如波普瑞韦,抗免疫剂如特比萘芬等。

其中达芦那韦已得到李兰娟团队体外细胞试验证明,达芦那韦在300微摩尔浓度下,能显著抑制病毒复制,与未用药物处理组比较,抑制效率达280倍。目前该药被建议将其列入国家卫健委《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第六版)》(注册号:ChiCTR2000029541)。

广州智睿医药科技有限公司欢迎相关企业和研究机构与攻关团队合作,共同抗击2019-nCoV。公开部分研究信息,希望能对寻找抗新型冠状病毒2019-nCoV药物的发现和开发有所帮助。研究团队后续将继续深入开展针对性的抗2019-nCoV活性测试,为临床研究和治疗提供更加直接的指导!

图1,对2019-nCoV可能有治疗作用的活性物质举例